Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PGPEP1LA6NFU8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PGPEP1LA6NFU8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PGPEP1LA6NFU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms