Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM247A6NEH6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM247A6NEH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms