Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALM3A6NDB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALM3A6NDB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALM3A6NDB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALM3A6NDB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms