Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRD1A4D1F6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRD1A4D1F6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRD1A4D1F6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRD1A4D1F6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1679.9 ms