Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
A0A1W2PQD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A1W2PQD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1W2PQD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1W2PQD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms