Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMTA1Q9Y6Y1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAMTA1Q9Y6Y1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms