Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNCAIPQ9Y6H5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNCAIPQ9Y6H5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNCAIPQ9Y6H5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms