Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX5Q9Y5X3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX5Q9Y5X3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX5Q9Y5X3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX5Q9Y5X3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms