Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms