Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB5Q9Y5E4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB5Q9Y5E4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB5Q9Y5E4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB5Q9Y5E4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms