Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCDHB6Q9Y5E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDHB6Q9Y5E3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB6Q9Y5E3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB6Q9Y5E3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms