Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH1Q9Y2L9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRCH1Q9Y2L9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRCH1Q9Y2L9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRCH1Q9Y2L9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms