Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRPC6Q9Y210 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPC6Q9Y210 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPC6Q9Y210 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPC6Q9Y210 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC6Q9Y210 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC6Q9Y210 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC6Q9Y210 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC6Q9Y210 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPC6Q9Y210 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms