Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SATB2Q9UPW6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SATB2Q9UPW6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SATB2Q9UPW6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB2Q9UPW6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms