Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRQQ9UMZ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRQQ9UMZ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRQQ9UMZ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRQQ9UMZ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRQQ9UMZ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms