Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LQ9UL33 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LQ9UL33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LQ9UL33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms