Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC13A4Q9UKG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A4Q9UKG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A4Q9UKG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A4Q9UKG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms