Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX25Q9UHL0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX25Q9UHL0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX25Q9UHL0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX25Q9UHL0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX25Q9UHL0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms