Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NPC1L1Q9UHC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPC1L1Q9UHC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NPC1L1Q9UHC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NPC1L1Q9UHC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NPC1L1Q9UHC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NPC1L1Q9UHC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms