Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
MLH3Q9UHC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MLH3Q9UHC1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MLH3Q9UHC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
MLH3Q9UHC1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MLH3Q9UHC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms