Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SRRDQ9UH36 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRRDQ9UH36 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRDQ9UH36 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRRDQ9UH36 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms