Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDH10Q9P2E7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDH10Q9P2E7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDH10Q9P2E7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDH10Q9P2E7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms