Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALCOCO1Q9P1Z2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms