Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RDH8Q9NYR8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RDH8Q9NYR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RDH8Q9NYR8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms