Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MIS18AQ9NYP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MIS18AQ9NYP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MIS18AQ9NYP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MIS18AQ9NYP9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
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