Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPD4Q9NXE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMPD4Q9NXE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD4Q9NXE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMPD4Q9NXE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms