Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCF3Q9NUQ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF3Q9NUQ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms