Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA3Q9NST1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PNPLA3Q9NST1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms