Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCND1Q9NSA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCND1Q9NSA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCND1Q9NSA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCND1Q9NSA2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms