Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLBQ9NRJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLBQ9NRJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAPOLBQ9NRJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAPOLBQ9NRJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms