Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FANCFQ9NPI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCFQ9NPI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FANCFQ9NPI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FANCFQ9NPI8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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