Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRA1Q9HD15 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRA1Q9HD15 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRA1Q9HD15 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRA1Q9HD15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.6 ms