Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A5

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10Q9H9A5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT10Q9H9A5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT10Q9H9A5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT10Q9H9A5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT10Q9H9A5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms