Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCAS3Q9H6U6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCAS3Q9H6U6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCAS3Q9H6U6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCAS3Q9H6U6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms