Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRTNQ9H040 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRTNQ9H040 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRTNQ9H040 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRTNQ9H040 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms