Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
C20orf27Q9GZN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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C20orf27Q9GZN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C20orf27Q9GZN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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