Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms