Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ROPN1BQ9BZX4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1BQ9BZX4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1BQ9BZX4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ROPN1BQ9BZX4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms