Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NSD3Q9BZ95 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NSD3Q9BZ95 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NSD3Q9BZ95 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NSD3Q9BZ95 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NSD3Q9BZ95 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms