Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM106CQ9BVX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM106CQ9BVX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM106CQ9BVX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms