Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFHD1Q9BUP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFHD1Q9BUP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHD1Q9BUP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms