Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RSG1Q9BU20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RSG1Q9BU20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms