Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM208Q9BTX3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM208Q9BTX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms