Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
THUMPD2Q9BTF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
THUMPD2Q9BTF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
THUMPD2Q9BTF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
THUMPD2Q9BTF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms