Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRADC1Q9BSG0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRADC1Q9BSG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRADC1Q9BSG0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms