Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MESP1Q9BRJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MESP1Q9BRJ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MESP1Q9BRJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms