Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF4Q9BQW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF4Q9BQW3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF4Q9BQW3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EBF4Q9BQW3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms