Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX50Q9BQ39 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX50Q9BQ39 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX50Q9BQ39 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX50Q9BQ39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms