Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GDF15Q99988 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF15Q99988 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF15Q99988 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GDF15Q99988 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF15Q99988 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms