Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CITED4Q96RK1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CITED4Q96RK1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CITED4Q96RK1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CITED4Q96RK1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms